1936年—1946年

1936年7月，学校更名为广西大学医学院。1937年2月，学校更名为广西军医学校。1939年4月， 学校更名为广西省立医药专科学校。1939年9月，学校恢复更名为广西省立医学院。1940年2月， 学校及附属医院迁往桂林，以七星岩栖霞寺为校址复课、开诊。1944年9月，桂林告急， 学校先后分路迁往昭平、八步、融水、三江等地。1945年8月，日本投降，抗战胜利， 同年11月学校全部师生返回桂林。1946年7月，学校迁入桂林栖霞路新址办学。